微生物菌劑的肥效持續(xù)時間長，可以減少化肥的施用量，并且它本身無毒無害。大量施用化肥、農藥，使土壤受到不同程度的污染，產(chǎn)生一定的毒性。生長在受污染土壤的作物，除了造成生長障礙外，其產(chǎn)品還會對人類帶來危害。消除土壤污染是環(huán)境治理的重要事情。

  鹽堿地的共性是有機質含量低，土壤理化性狀差，對作物生長有害的陰、陽離子多，土壤肥力低，作物不易促苗。鹽堿地不易發(fā)苗，施肥總的原則是增施復合微生物肥料和生物有機肥，適當控制化肥施用?；室嗍┯袡C質含量高的生物有機肥，減少化肥施用量，而化肥盡量不靠近種子，以免增加土壤溶液濃度，影響發(fā)芽。追肥根據(jù)情況，避免過量。在有條件的地方，可以大量采用秸稈還田，種植耐鹽堿的綠肥等辦法，減少鹽堿對作物的危害。

    粘土地一般含有機、無機膠體多，土壤保肥能力強，養(yǎng)分不易流失。但粘土供肥慢，施肥后見效也慢，這種土壤“發(fā)老苗不發(fā)小苗”，肥效緩而長，土壤緊實，通透性差，作物發(fā)根困難。這種土壤施用復合微生物肥料和生物有機肥，通過豐富的有機質和有益微生物的活動，增加通透性，提高保肥保水能力。這類土壤性質發(fā)陰，如施用少量未經(jīng)腐熟的馬糞配合復合微生物肥料和生物有機肥，效果會更好。

    砂土地要大量增施生物有機肥，提高土壤有機質含量，改善保肥能力。由于砂土通氣狀況好，土性暖，有機質容易分解，施用未完全腐熟的有機肥料受影響比粘土地要小。有條件的地區(qū)可種植耐瘠薄的綠肥，以改良土壤理化性狀。

微生物菌劑施入土壤后，有益微生物在土壤中迅速繁殖，會產(chǎn)生多種對作物有益的代謝產(chǎn)物。這些代謝產(chǎn)物可刺激或調控作物生長，使作物健壯，達到增產(chǎn)目的。不僅給作物生長提供所需的NPK和中微量元素外，還能為作物提供有機質和有益微生物活性菌。 除此之外，微生物菌劑中的一些菌種還可以分泌一些刺激素維生素等以刺激作物生長，使作物健壯，營養(yǎng)狀況得到改善
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